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鲨鱼抗体制备服务

多种人源化策略综合设计包括计算机同源3D建模、表面氨基酸突变、基于生物信息学和结构生物学模拟设计。


鲨鱼抗体制备服务

 

鲨鱼产生的IgNAR是一种仅含有重链的抗体,其可变部分VNAR(Variable New Antigen Receptor)是天然存在的最小的单域抗体,分子量约为11-12kDa。与IgG的VH/VL结构不同,VNAR仅包含两个CDR区域:CDR1和CDR3。与IgG中的相应区域相比,CDR3通常较长(平均长度为15~17个氨基酸),且结构上变化更大。通过序列分析发现,VNAR与人类源抗体可变区的同源性约为25%-30%。然而,基于现有VNAR的晶体结构数据,发现VNAR的结构与人源抗体可变区的结构具有较高的相似度,因此可以通过框架移植实现对VNAR的人源化改造。


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图1 不同类型抗体的结构示意图


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图2 不同类型的VNAR示意图

(左侧为VNAR序列的特征图,其中黑点为典型半胱氨酸残基,白点为非典型氨基酸残基,黑色实线和虚线为二硫键。右侧为不同类型VNAR的三维结构模型,其是通过Pymol软件对已报道的VNAR序列进行同源建模而获得)


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图3 VH、VHH和VNAR结构示意图



VNAR做为特殊结构的单域抗体具有以下特点:

1、小型结构:VNAR结构紧凑是自然界中分子量最小(<11kDa)的抗原结合单位

2、稳定性:VNAR具有较高的热稳定性和耐酸碱性,在不同的温度和pH条件下保持较好的稳定性。

3、高亲和力和特异性:VNAR较长的CDR3区域使其表现出与抗原结合的高亲和力和特异性。

4、人工选择的多样性:VNAR可以通过体外选择或人工设计来获得,使其具有较大的多样性和可塑性。

 


服务流程


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服务优势


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